Postdoc - Développement d’outils de surveillance multi-échelles de la diversité fongique dans les espaces forestiers en libre évolution
Missions :
La personne recrutée sera mobilisée pour analyser des données déjà acquises, avec des marqueurs courts et des marqueurs longs, pour comparer le niveau taxonomique, ainsi que les outils d’assignations disponibles pour assurer le lien avec les bases de données sur l’écologie des taxons. L’assignation par placement phylogénétique des données sera testée à partir des fragments longs. Cette étape permettra d’évaluer si l’ADNe séquencés en marqueurs long est à la fois suffisamment conservé pour rester représentatif et informatif taxonomiquement.
Un autre volet du travail concernera le calcul de différentes métriques de diversité beta en analysant leur sensibilité à la quantification des MOTU (ou espèce) et le poids donné aux MOTUs (ou espèces) rares dans le jeu de données. L’objectif est de pouvoir identifier les processus écologiques à l'oeuvre dans les tendances constatées en termes d’évolution de la diversité globale et aux différentes échelles spatiales. Une analyse de sensibilité sera conduite pour évaluer l’influence, sur ces différentes métriques, de l’effort d’échantillonnage déployé à différentes échelles spatiales.
Enfin, la personne recrutée participera activement au développement du dispositif MétaMyco et oeuvrera à son déploiement à l’ONF, avec l’aide des membres du réseau mycologie de l’ONF.
Activités :
- Analyser les données
- Rédiger deux publications scientifiques sur la base des résultats obtenus
- Collaborer avec les différents partenaires du projet
- Participer à plusieurs mission de terrain pour des prélèvements de sol, d’abord en tant qu’opérateur, puis en tant que formateur.
Le projet se déroulera au sein de l’UMR DYNAFOR, avec un hébergement à l’Ecole d’Ingénieurs de PURPAN (Université de Toulouse). Le travail sera réalisé en étroite collaboration avec Mélanie ROY (UMR CRBE, Université de Toulouse) et Arnaud Giraudel (Office National des Forêts, réseau mycologique et recherche / développement). Un comité de suivi du projet, incluant d’autres experts mycologiques, est également prévu.
